Kalandussektori innovatsioonitoetuse eesmärk on soodustada uute, suurema lisandväärtusega toodete, teenuste ja tehnoloogiate arendamist Eesti kalandussektoris. Toetust saavad taotleda nii kalapüügi- ja vesiviljelusettevõtjad kui ka nende toodete töötlemisega tegelevad ettevõtjad.