Põllumajanduse seisukohalt valmistab kõige enam muret eelnõu punkt, millega täiendatakse looduskaitseseadust punktiga, mis sätestab, et tegevuste kavandamisel ja elluviimisel tuleb vältida looduslikult esinevate lindude tahtlikku häirimist. Eelnõu seletuskirjas esitatud tahtlikkuse definitsioon välistab lindude pesitsusajal looduses kõikvõimalikud inimtegevused, mõjutades eeskätt majandustegevust põllumajandus- ja metsasektoris ning on EPKK seisukohalt selgelt ebaproportsionaalne. Nagu ka eelnõuga plaanitud trahvimäärade tõus, mis juriidilise isiku korral suurenevad kuni 100 korda.